Bootstrap の1フェーズで、[bootstrap.repos] に宣言した git リポジトリを clone / 収束（更新）する
- path をキーに checkout 先を宣言し、各 repo に pre/post hook を挟める。
mise bootstrap repos applyで適用、status（--missingで未取得のみ）で同期状態を確認する - 適用時は dirty tree（未コミット変更）や origin mismatch を安全チェックし、意図しない上書きを防ぐ